дело в том, что в /etc/init.d. находятся стартовые скрипты системы, но никак не юзверьские.
а вот юзверьские автозагрузки очень сильно зависят от того окружения рабочего стола который запущен. В KDE в одном месте, в GNOME - в другом, в uniti - ещё где-то спрятаны.
Но направление поиска следующее:
~/.название_оболочки
где ~ означает домашний каталог пользователя.
Каталог с настройками оболочки начинается с точки ибо в юникс системах нет атрибута "скрытый", а принято, что скрытые файлы начинаются с точки.
Ну а дальше расковыряешь - поймёшь.