Причин может быть несколько. Проверьте, есть ли вода в поилке и пьет ли из нее самка.
В корм добавляйте ежедневно пищу с высоким содержанием белка - это молочные продукты (творог, кефир, йогурт несладкий, сыр) , вареное яйцо, отварные рыба и мясо, бобовые (горох, фасоль) . Часто из-за отсутствия достаточного количества белка в пище хомячихи убивают и поедают детенышей. Да и сам по себе рацион кормячей самки должен быть разнообразным.
Не тревожьте самку, не открывайте домик-гнездо и не берите первые дни хомячат руками (мать сразу почувствует на своих детях посторонний запах)
Обычно по какой-то из этих причин хомячихи и убивают детей. Хотя молодые первородящие самки могут делать это и без какой-то конкретной проблемой. Так же часто самки убивают слабых и нежизнеспособных хомячат - при этом сильных и здоровых не трогают.