почему 50% прибыль-это 50 к сотне, а не сотня делённая на пополам (двойной доход)? можно ли выгодно исправить бухгалтерию?

бухгалтер, милый мой бухгалтер, вон ты какой....

Смотря от чего отталкиваться.

Вопрос хрен поймешь, но можно выделить 2 момента:
1) от чего считать проценты
2) как схимичить с бухгалтерией

1 момент - это математика и здравый смысл - как эту математику применить.
2 момент - кто его знает вашу кухню