Как правильно написать заявление в прокуратуру на проверку деятельности работы ИП (магазина)?

Форма - я думаю без разницы. Самое главное четко сформулировать претензии к магазину и подтвердить доказательствами.

Прокуратура дает разрешение на проверку, а не проверяет. А проверяет Роспотребнадзор, иные контролирующие органы. Вот они и должны обратиться в прокуратуру с заявлением о даче разрешения на внеплановую проверку, а не вы.