Как расчитать ЕНВД?

На сегодняшний день при расчете ЕНВД применяются корректирующие коэффициенты К1 (коэффициент-дефлятор) и К2 (учитывает особенности деятельности) . Они указываются при расчете налога в разделе 2 декларации по ЕНВД. Значение К1 устанавливается на каждый календарный год, при этом этот коэффициент должен быть обязательно опубликован.
К1 устанавливается госдумой на всю Россию, и равен сейчас 1,295. А К2 устанавливают местные власти и для каждого района, муниципального образования, он свой. Опять исходя из вида деятельности устанавливается. Посмотрите на офиц сайте своего города - там должна быть эта информация. В крайнем случае в налоговой спросите.
Значение коэффициента К2 устанавливается местными властями от 0,005 до 1 и может отличаться при расчете налога по разным территориальным образованиям. Минфин России в Письме от 14.08.2007 г. № 03-11-02/230 напомнил, что значения корректирующего коэффициента базовой доходности К2 муниципальные власти устанавливают на период не менее, чем один календарный год. Это означает, что в течение календарного года значения коэффициента меняться не могут. Кроме того, нормативные правовые акты, устанавливающие или изменяющие его значение на очередной календарный год, должны быть приняты вовремя.
Формула расчета ЕНВД за квартал:

(базовая доходность) × (физпоказатель) × К1 × К2 × (3 месяца) × (ставка налога 15%) = ЕНВД за квартал
у вас физический показатель -Количество транспортных средств, используемых для перевозки пассажиров и грузов, а базовая доходность 6 000..
т. е. 6000 х на кол-во машин х К1(это 1.295) х К2 х 15%

ЕНВД считается на общее количество машин

Если на ЕНВД - не имеет значения, сколько дней в конкретный месяц работала данная машина. Если на ОСН - там расчет налогов не зависит от физического показателя, он зависит от полученных доходов. Так что вы уж как-то разгребите эту кашу - ОСН и ЕНВД, а то все в одну кучу. Может быть у вас на ЕНВД этот вид деятельности (перевозка грузов) , а все остальное на ОСН? Еще поясню - если в данный налоговый период транспортное средство вообще не использовалось, оно может не включаться в расчет. И не имеет значения, что автомобиль оставался на балансе организации, исправен или нет. Главное - он не использовался ( в журнале регистрации путевых листов нет отметок о выдаче путевки на этот автомобиль - главное тому доказательство).

Статья 346.29. Объект налогообложения и налоговая база

Физический показатель - количество автотранспортных средств, используемых для перевозки грузов. Т. е. нужно учитывать все машины.