Одинаково ли индексируются страниц и субстраница на сайте

Играет роль не вложенность папок на сайте, а длина перехода с главной страницы сайта на другую страницу. Страница может находиться глубоко в поддиректориях, но если на неё ведет прямая ссылка с главной страницы, то она будет индексироваться лучше, чем страница в корне сайта, но на которую можно попасть только пройдя через десяток других страниц сайта.

Покупные ссылки размещаете не Вы сами, а тот вэб-мастер, который продает места на своих страницах под покупные ссылки. Вам нужно только написать текст ссылки и адрес, куда должна вести ссылка на Ваш сайт. Ну и Вы должны выбрать те сайты и те их страницы, на которых Вы хотите разместить ссылки, ведущие на Ваш сайт. Это всё делается в специальных биржах по продаже ссылок. Это можно сделать, например в "Бирже ссылок для продвижения в Яндексе" или в "Бирже ссылок для раскрутки в Яндексе и Гугле.

Для выбора трастовых доноров для своего сайта можно воспользоваться сервисом "Проверка траста в Яндексе".
Поисковики хорошо относятся к ссылке и учитывают её в ранжировании с более высоким весом, когда ссылка на Ваш сайт идет не "голой", а в тематической "шубе". Для этого существуют сервисы по размещению Ваших статей на других сайтах.

Например, можно воспользоваться услугами сервиса "Биржа статей для продвижения в поисковиках" и при помощи еще одной "Биржи статей для раскрутки сайта".