L - длина моря (померить по карте) .
Зная длину дуги и радиус окружности можно найти угол α. Зная α и прилежащий катет в прямоугольном треугольнике находим гипотенузу. Отнимаем от неё радиус Земли. Останется высота.

Немного ошибся по памяти. Радиус Земли приблизительно 6 370 км. Чертёжик лишь для наглядности, соотношения не соответствуют действительности.