В чем различия первичного раздела жесткого диска от логического раздела?

первый делайте основным
второй (Линукс) тоже основным
остальное пространство - дополнительным
в дополнительном разделе создавайте логические диски

хотя в вашем случае (три диска и Windows XP) можно все разделы делать основными

основные разделы, "правильней", но у них есть следующие особенности:
- их может быть всего четыре (если нужно больше, то один из разделов надо сделать дополнительным и разбить его на логические диски)
- Windows 98 не умеет рабоать несколькими основными разделами (виснет нафег :), у XP таких проблем, впрочем, нет

Дополнительный раздел - средство обхода ограничения в 4 раздела, его можно разбить на необходимое количество логических дисков.

У логических дисков (на которые разбивается дополнительный раздел) другие особенности:
- их может быть больше 4 (в т. ч. РЕАЛЬНО много, но нормальные люди для этого создают каталоги :) большое количество разделов несколько повышает устойчивость данных (если вдруг "упадет" один из разделов то вы потеряете не все данные сразу) , но лучше делать бекапы :)
- у них сложнее с загрузкой ОС

Самое главное - загрузочные разделы должны быть первыми и желательно в пределах первых 8 Гб диска ! (это уменьши возможные проблемы загрузки).

первичных может быть тока 4.
до последнего времени так было :)
Первичныйраздел может быть вторичным :) и его можно разбить на почти неограниченное количество логических.
стартовать тачка мобет тока с первичных.. . но и это не проблемма если есть мультибут.
Чтото есть гомосексуальное в логических дисках. особено многим ненравится отвратительная манета многих осей называть их длинными и трагичными именами.. . но ничего страшного в них нет. Линуксоиды иногда творят их десятка полтора.. . для повышения устойчивости файловой системы.. .

ЗЫ Но