Всплывает реклама повсюду, после скачки какого-то файла, удалила все что скачивала, AVG не находит угроз Что еще делать?

Это вредоносная реклама . И её надо удалять как вирус.

С помощью утилиты Dr.Web CureIt!® без установки Dr.Web в системе Вы можете быстро проверить Ваш компьютер и, в случае обнаружения вредоносных объектов, вылечить его.

http://www.freedrweb.com/cureit

Антивирусная программа Malwarebytes Anti-Malware (MBAM) предназначена для быстрого сканирования системы в поисках различных видов вредоносного ПО и лечения самых сложных заражений http://www.comss.ru/page.php?id=84

Программа Adguard — это лучший способ избавиться от раздражающей рекламы, защититься от онлайн-слежки и мошеннических сайтов.

http://adguard.ru/?aid=1689

Почему стоит использовать антибаннер?

‪1.‬Adguard удаляет рекламный спам, ускоряет загрузку страниц и экономит трафик.
‪2.‬Работает со всеми браузерами: Internet Explorer, Opera, Firefox, Chrome, Safari.
‪3.‬Блокирует видеорекламу, рич-медиа и другие необычные виды рекламы. Предотвращает отслеживание рекламными сетями и счетчиками.
‪4.‬Антибаннер начинает работу сразу после установки, не требует настройки и регулярно обновляется.
Программа платная 199 рублей на 1 год использования.

Утилита AdwCleaner помогает искать и удалять надоедливые панели инструментов, нежелательные плагины, дополнения и расширения в вашем веб-браузере, а также различные рекламные компоненты и hijacker-утилиты

http://www.comss.ru/page.php?id=1309

Используй приложение
Uninstall Tool - простая и удобная утилита для полного удаления программ
http://www.comss.ru/page.php?id=1493

Ccleaner по очистке мусора и временных файлов на компе
http://ccleaner.org.ua/download/
AdwCleaner
Утилита AdwCleaner помогает искать и удалять надоедливые панели инструментов, нежелательные плагины,
http://www.comss.ru/page.php?id=1309

Установи на браузер расширения
Ghostery
Adguard АнтиБаннер

Последовательное сканирование этим:
http://www.emsisoft.com/en/software/eek/
http://www.freedrweb.com/cureit/
http://www.comss.ru/page.php?id=1309
И пересоздание ярлыков для всех браузеров.

Не каких приложений не надо качать... Просто зайди через безопасный режим и поудаляй подозрительные файлы.

Переустанови, есть конечно способ, но переустановка лучше помогает, а вообще удали всякие амиго, суперзагрузчики из программ в панели управления, если ты еще так не сделала.