Модифицировать программу таким образом,чтобы значения X, F1и F2 были представлены двумерным массивом,состоящим из 3строк

Как-то так...

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <time.h>
#include <math.h>
#include <locale.h>
int main() {
    double * x, *f1, *f2, ** mx, d = 1000;
    int row = 3, col, r, c;
    size_t size = sizeof(double);
    char msg[] = "\a Не удалось выделить память под ";
    setlocale(LC_CTYPE, "Russian_Russia.1251");
    printf(" Введите число точек: ");
    scanf_s("%i", &col);
    srand((unsigned)time(NULL));
    if (x = (double*)malloc(col * size)) {
        for (c = 0; c < col; ++c) x[c] = rand() / d;
        if (f1 = (double*)malloc(col * size)) {
            for (c = 0; c < col; ++c) f1[c] = rand() / d;
            if (f2 = (double*)malloc(col * size)) {
                for (c = 0; c < col; ++c) f2[c] = rand() / d;
                if (mx = (double**)malloc(row * sizeof(double*))) {
                    mx[0] = x; mx[1] = f1; mx[2] = f2;
                    for (r = 0; r < row; ++r, printf("\n")) for (c = 0; c < col; ++c) printf(" %6.3Lf ", mx[r][c]);
                    for (r = 0; r < row; ++r) free(mx[r]);
                    free(mx);
                    mx = NULL;
                } else {
                    free(f2); free(f1); free(x);
                    f2 = f1 = x = NULL;
                    printf("%sматрицу\n", msg);
                }
            } else {
                free(f1); free(x);
                f1 = x = NULL;
                printf("%sмассив F2\n", msg);
            }
        } else {
            free(x);
            x = NULL;
            printf("%sмассив F1\n", msg);
        }
    } else printf("%sмассив X\n", msg);
    fflush(stdin);
    getchar();
    return 0;
}