Подскажите, имя в загран-паспорте написано Viktoriia. А в других сертификатах Viktoriya или Viktoria. Что делать?

ФМС ничего не должен исправлять. просто сейчас поменяли прогамму, вот и выходин не много по разному.
вот к примеру мой знакомый также получал загранпаспорт старого образца в январе,
в нем указанно имя:
АНДРЕЙ/
ANDREY
в сентябре знакомый оформил загранпаспорт нового поколения в нем указанно:
АНДРЕЙ/
ANDREI
.
Ничего страшного в этом нет. и так и так все правильно.

А что такое "другие сертификаты"?

Пусть УФМС исправляют свою ошибку, ошибка серьезная.

Вообще-то, допускаются ошибки.. . НАДО СПРАШИВАТЬ...

Всю эту хрень доказывать придется упертому таможеннику, явно имеющему на Вас виды в качестве источника для пополнения личного бюджета...

Мы тоже столкнулись с такой проблемой, правда, пока без последствий.
У меня в заграннике фамилия была с лишней буквой-не как у мужа. Потом муж поменял паспорт-фамилии сравнялись, но не такие как на других документах и у его родителей. Теперь я поменяла паспорт-фамилия поменялась, а муж остался с прежней. Сын записан в наших паспортах с разными фамилиями.
Могу только посочувствовать, вряд ли Вы что-то измените. Какой-то не очень грамотный (не в грамматическом смысле) товарищ придумал документ, по которому и переводятся наши имена и фамилии. Я до сих пор не понимаю, почему я имею право выбрать себе имя, заменить его, и не могу повлиять на его написание в загранпаспорте?

У меня тоже такое было, но всё прошло гладко.

Если возникли проблемы, то можно в судебном порядке признать, что лицо, записанное в таком-то документе так, а в другом этак, является одним и тем же лицом.