Пустила квартирантов, прописка в нашем городе у них есть, но участковый сказал, что должна сделать временную регистрацию

Понятие регистрация по месту жительства (постоянная) или по месту пребывания (временная) относится к конкретному жилому помещению, а не к городу или району.
В данном случае Ваша квартира является для этих граждан местом пребывания.
Поэтому по истечении 90 дней пребывания нужно подать документы для их регистрации по месту пребывания согласно Адм. регламенту регистрации граждан
10. Гражданин, прибывший для временного проживания в жилое помещение, не являющееся его местом жительства, на срок свыше 90 дней, по истечении указанного срока обращается с заявлением о регистрации по месту пребывания по установленной Регламентом форме к должностным лицам, ответственным за регистрацию, а при их отсутствии к собственнику жилого помещения.
16. Для регистрации по месту пребывания гражданин представляет лицам, ответственным за регистрацию:

документ, удостоверяющий личность;

заявление о регистрации по месту пребывания по форме N 1 (приложение N 1 к Регламенту) ;

документ, являющийся основанием для временного проживания гражданина по указанному адресу (договор найма (поднайма) , заявление лица, предоставившего гражданину жилое помещение) .

Если указанная в п. 10 обязанность не будет исполнена в срок, то участковый может возбудить дела об административных правонарушениях по ч. 1 ст. 19.15 КоАП РФ на проживающих у Вас граждан и по ч. 2 ст. 19.15 - на Вас
http://www.consultant.ru/popular/koap/13_20.html#p6019
Статья 19.15. Проживание гражданина Российской Федерации без удостоверения личности гражданина (паспорта) или без регистрации

1. Проживание по месту жительства или по месту пребывания гражданина Российской Федерации, без регистрации по месту пребывания -
влечет наложение административного штрафа в размере от одной тысячи пятисот до двух тысяч пятисот рублей.

2. Допущение гражданином проживания в занимаемом им или в принадлежащем ему на праве собственности жилом помещении лиц без регистрации по месту пребывания -
влечет наложение административного штрафа в размере от двух тысяч до двух тысяч пятисот рублей.

Добавлю к ответу выше, что срок проживания в 90 дней практически невозможно доказать, поэтому и привлечь к ответственности почти невозможно.. . ну если вы или ваши квартиранты сами не признаются.

правильно говорит, если чего надо будет-где их искать?

А че тут доказывать? Участковый уже в курсе. Будьте уверены-через 90 суток прибежит штрафовать :)

Тебе это надо, или ему, если ему надо, то пусть он и делает.