Фараонов муравей любит темноту, тепло и влажность. Он не строит муравейников. Для создания нового гнезда ему достаточно найти небольшую выемку в фундаменте отапливаемого здания, пустоту между кирпичами и блоками, щель в стене или полу. Довольно часто гнезда фараонова муравья находят в редко передвигаемых картонных коробках, под подоконниками и внутри мебели, за кафелем, под плинтусами. Особенно неравнодушен этот муравей к кухням, столовым, продуктовым магазинам и складам. Маленький размер и крепкие челюсти позволяют этим пронырливым насекомым пробраться в любое место. Не являются для них преградой на пути к добыче ни полиэтиленовый пакет, ни дверца холодильника. Находили их даже в больницах в хирургических инструментах, капельницах и запечатанных упаковках стерильных бинтов.
.

Кроме прямого вреда запасам продуктов, фараонов муравей взят на подозрение как загрязнитель пищи, разносчик бактерий и вирусов, возбуждающих болезни, такие как полиомиелит, стрептококковые и стафилококковые инфекции. Фараоновы муравьи, как и тараканы, достаточно устойчивы к бытовым средствам борьбы с насекомыми.
Важно знать, что по квартире бегает лишь небольшая часть муравьев, большая же часть находится в гнёздах, поэтому и бороться с ними очень сложно. Борьба с фараоновыми муравьями основана на знании, что рабочие особи кормят личинок и самок. Следовательно, концентрация яда в приманке должна быть не слишком велика, чтобы муравей не погиб слишком быстро, а успел донести отраву до колонии. Например, концентрация в приманке борной кислоты (ее часто используют в борьбе с фараоновым муравьем) не должна превышать 2%, тогда она подействует на всю колонию. Вот надежный и проверенный практикой рецепт убийственной смеси для колонии: на 1 л воды 50 г буры, 100 г меда и 400 г сахара. Но это не быстрый способ.
Еще муравьи любят тепло. Достаточно подержать квартиру или дом без отопления - муравьи уйдут сами, но не факт, что не вернутся.