На озере Байкал в процессе эволюции возникло 7 новых семейств и подсемейств, 52 рода и не менее 400 новых видов. Почему?

Да тут же несложно всё!.
Вовсе не нужно искать сверхъестественное там, где его нет, и даже более того - там, где как раз наиболее ярко - классически, как "по книжке", проявляются законы биологии - в данном случае - закономерности видообразования.

Вопрос об их систематическом уровне ("именно 7 семейств и 52 рода") - это уже дело систематики, то есть на самом деле - не столь важно.
Какого бы ранга эти организмы ни были - важнее то, что они именно особенные, больше нигде не встречающиеся.
Поэтому и число их важно не в связи с какой-то цифрой как таковой, а в доли от общего числа видов: там гораздо более половины всей фауны эндемична (то есть есть только тут) .

Итак: особенность живого мира (в первую очередь животного населения) Байкала - это из-за редких свойств его воды (очень малое содержание солей, низкие температуры и очень плавный годовой ход температур, который затрагивает только верхние приповерхностные слои, а на глубине вообще температуры постоянны, большие глубины, прозрачность воды, бедность органикой, твёрдость грунтов и субстрата - там почти веде скальные выходы, т. е. частички их в воду тоже почти не попадают, она не мутнеет) + сохранения этих свойств в неизменном состоянии ооочень длительное время + довольно существенная изоляция этого водоёма от окружающих; от океана в первую очередь.

В общем, коротко говоря - тут редкие условия, которые сохраняются такими длительное время и при этом почти нет связи с другими водоёмами (из Байкала ведь вытекает одна река - Ангара - но она не глубока, поэтому в неё "сливается" только верхний слой воды, нижние остаются неизменными..) .

Что в таком случае остаётся делать когда-то попавшим сюда живым организмам, как не приспосабливаться к этим особенным условиям?
А, поскольку условия почти нигде не повторяются (а, даже если и есть ещё где именно такие - так с этими водоёмам у Байкала связи нет) - так вот оно и получается, редкое своеобразие.
Ведь эти организмы не могли переместиться куда-то ещё, "перемешаться" с другими.
Если совсем попросту - они долго "варились в собственном котле". Так долго, что стали не похожи ни на кого другого более, только на самих себя, и далеко "ушли в сторону" от каких-то предковых форм (вероятно, приспособленных к более "обычным", широко распространённым условиям среды) .

И, кстати, такие организмы называются эндемики, причём узколокальные эндемики (то есть распространены они на очень и очень ограниченной территории) , а по их способности к освоению разных сред - стенобионты (то есть привыкшие к очень узкому диапазону условий, вне которого они существовать не смогут) .

Сейчас проблема-то в другом: загрязнение, как ни крути, - есть. От разных источников, но есть - и несомненное. А это значит, что хим. состав воды медленно, но меняется. Смогут ли эти живые организмы перестроиться, приспособиться?. . Вопрос сложный.
Ещё и из Монголии по Селенге стало попадать больше, чем обычно, орг. вещества и просто взвешенных наносов (частичек почвы, горных пород и т. п. ) - они там всё экстенсивное сельское хозяйство развивают, вот ещё грозятся открытым способом месторождения полезных ископаемых разрабатывать - а всё потечёт в Байкал. .
А ещё бассейн Селенги - это зона аридизации (опустынивания) , т. е. там вообще почвенный покров сильно нарушается при нерациональном ведении хозяйствования, и все-все сбросы-стоки опять в Байкал попадут.. .
Это сложности для экосистемы местной, даже прямо сказать - могут быть серьёзные проблемы.
Очень уж хочется, чтоб Байкал на самом деле остался тем уникальным водоёмом, что есть сейчас, а не просто в памяти и на картинке..

Они не возникли, а были кем то запущены. Как можно объяснить, что появилось именно 7 видов и 52 рода?? ? Да, невозможно это объяснить, надо просто принять, как факт!

уникальная экологическая ниша