английский. Как будт правильно He usually comes to the factory или же He usually is coming to the factory

смотря как вам нужно чтобы звучало на русском, эти варианты имеют слегка разный перевод

Когда вы говорите he is coming - это значит, что он сейчас приходит, он идет, он в процессе прихода.

Ну не скажите вы ведь что-то типа ---Он обычно сейчас идет. Не говорят так.

Слово обычно (usually) никак не может сочетаться с -ing формой.

Так что ПЕРВЫЙ вариант