если ты хочешь полностью отказаться от винды, то лучше все-таки полностью переформатировать диск, ntfs- не родная файловая система, хоть и бубуна прекрасно с ней работает.
Лучше всего сделать так: взять у знакомого винт, перекинуть туда инфу, а после установки закинуть инфу назад на свой винт.
Жестких требований по разметке диска нет, но можно предложить такой вариант: 20-30гиг под корень (систему "/"), под своп столько, сколько у тебя оперативы, и под домашнюю папку "/home" (хотя можно и произвольное имя - это аналог диска D)
все оставшееся пространство. Естественно везде файловая система ext4, кроме свопа.
Если все же хочется не трогать диск D, то свои 100гиг делишь, как писал я выше, а диску D даешь точку монтирования, ну например "/media/D" (хотя опять же жесткого требова для точки монтирования нет, лишь бы ты знал, что и где находится)