могут ли судебные расходы превышать сумму иска?

могут. обычно тот, кто "проиграл" возмещает их тому, кто "выиграл"

Могут, поскольку судебные расходы состоят из государственной пошлины и судебных издержек (ст. ст. 88 ГПК, 101 АПК) .
Госпошлина "привязана" к сумме иска (если иск подлежит оценке) и понятно, что не превысит эту сумму, если только не найдется желающий судится за суммы менее 400 руб. в судах общей юрисдикции и 2000 руб. в арбитражных судах.
При этом судебные издержки - это целый перечень (причем, "открытый") различных видов расходов, которые никак не связаны с суммой иска (ст. ст. 94 ГПК, 106 АПК) .