через что в семя проходит воздух и вода

Влага и воздух проходят через саму оболочку, провоцируя зарождение и рост. Вся остальная информация о самом растении и о росте в том числе и питательные вещества заложены в самом семени. Их хватает для первоначального роста растения, далее росток начинает питаться ресурсами почвы.