Можно ли убирать компаньонов в Fallout 2,не убивая их?

Да, поговорить с ними. В диалоге есть опция типа "Ждать здесь" или "Нам лучше разбежаться на время".
Специально зашел в игру, посмотрел. Вот, например, у Вика предпоследняя строка в диалоге "I need you to wait here until I come back" ("Жди здесь, пока я не вернусь"). Не оставляйте их в рандомных локациях и тогда всегда сможете за ними вернуться.