доход налогоплательщика в целях налогообложения

В соответствии с п. 2 ст. 211 НК РФ - это доход, полученный налогоплательщиком в натуральной форме. НДФЛ удерживается в размере 13% от стоимости машинки (с учетом предоставленных вычетов, если они есть) . В данном случае - с 5500 руб. Цена реализации сторонним покупателям для работника роли не играет.
Но если отпускная цена 5500 руб. ниже цены приобретения, то предприятие будет платить налог на прибыль суммы занижения цены товара (рыночная цена - цена приобретения)

добавлю: Доля натуральных выплат за каждый месяц не должна превышать 20% от начисленного месячного заработка работника. Даже если сам работник пожелает получать зарплату в натуральной форме в большем размере, то и тогда превысить упомянутые 20% работодателю нельзя.
Нельзя принимать решение о выплате зарплаты натурой с превышением 20%-ного максимума. Это является нарушением трудового законодательства, за которое трудинспекция может оштрафовать:
- организацию - в размере от 30 000 до 50 000 руб. ;
- индивидуального предпринимателя и руководителя организации - в размере от 1000 до 5000 руб.
Поэтому если нет возможности выплачивать остальные 80% зарплаты деньгами, работодателю остается только копить долги перед работниками, начислять на них проценты и гасить задолженность уже тогда, когда деньги появятся.
Указанный лимит натуральных выплат исчисляется не от оклада (тарифной ставки) работника, а от совокупного месячного заработка работника. В него, наряду с окладом (тарифной ставкой) , включаются и иные выплаты, предусмотренные системой оплаты труда (надбавки, доплаты, премии и пр. )
В коллективном или трудовом договоре должна быть предусмотрена возможность выплаты части зарплаты натурой.
От каждого работника должно быть получено заявление на получение зарплаты в натуральной форме. В заявлении работник должен указать- какой конкретно продукцией он желает получать зарплату. Прежде чем брать заявления от работников о выплате части зарплаты продукцией, нужно определиться с ее стоимостью. В связи с этим руководитель должен издать приказ об установлении стоимости продукции. С этим приказом работников нужно ознакомить еще до того момента, как с них будут получены заявления. Ведь работники должны ясно себе представлять, какое количество продукции им будет выдаваться в счет зарплаты;