помогите, пожалуйста, совсем начинающему помощнику бухгалтера наладить и организовать документооборот.

Начните с кадровых документов. На каждую фирму отдельно заводите папку. Внутри папки можете формировать дела в алфавитном порядке или по дате приема на работу, как вам удобнее.
Выписки с банка, кассовая книга, расчеты с контрагентами - это бухгалтерия. В первую очередь, надо привести в порядок кассовые документы. Но так как вы только начинаете, советую сперва начать с банковских выписок это самое легкое. Пока соберете, уже будет какое-то понимание. Все документы собираются в нарастающем порядке. папки формируются по месяцам, кварталам или за год в зависимости от объема документов. По контрагентам формировать лучше по датам отгрузки товаров (работ, услуг) . Так легче будет найти документы при необходимости. Договоры - папка отдельно, формируем по датам, сразу заведите журнал регистрации договоров. на первом листе договора в углу ставим номер по журналу. В будущем легче будет найти необходимый документ.

Сначала разделить бумаги по фирмам. Потом первичку подшить: акты-накладные выходные (это ваша реализация) - одна папка, счета-фактуры выданные - другая папка, счета выданные - еще папка, тоже самое по входным документам. Разбивка по годам и по кварталам (если много. У меня входных документов мало - за год в 1 папку влезают) . Подшивать в хронологической последовательности, новые поверх старых. Потом составить в Экселе табличку по всем этим документам - номер, дата, контрагент, сумма, примечание. Потом на досуге счета-фактуры надо в журналы сшить поквартально (или помесячно, если много) - я, правда, такого не делаю, хотя надо бы.. . Договора разделить на кучки - вы продавец, вы покупатель, иные договора (например про займы) подшить в отдельные папки. У нас договора подшиты алфавитном порядке по контрагентам - т. к. котрагентов очень много, с каждым 1, редко 2 договора - так найти быстрее, но можно в хронологическом порядке по датам - тут как вам удобнее. Тоже опись составить. Выписки тоже подшить по хронологии. Выписки - имеется виду сама выписка с приколотыми к ней платежками. Если там клиент банк - с этим можно особо не париться - из клиент-банка все по новой распечатать. Ну и учредительные по папкам, кадры по папкам. . .У меня кадров мало, учредительные тоже места немного занимают. И т. д. , и т. п....

Отдельно по видам документов и по датам. Если нужны бланки, их можно взять бесплатно здесь https://www.moedelo.org/blanki-buhgalterskih-dokumentov