Значительны также и водные ресурсы. Многочисленные быстрые горные реки, протекающие в скалистых ущельях и имеющие крутое падение, могут быть использованы как источники гидроэнергии. Лесные массивы горных склонов отличаются высоким качеством древесины. Важную роль для развития животноводства играют луга высокогорья и горно-таежной зоны, особенно пастбища и сенокосы Алтая, Читинской области, Бурятской и Тувинской АССР.
На южносибирских хребтах берут начало великие российские реки Сибири: Катунь и Бия, сливаясь, дают начало Оби, Ка-Хем и Бий-Хем — Енисею, Шилка и Аргунь — Амуру. Реки Южной Сибири мощные, со стремительным течением, порогами и водопадами. Много здесь сфагновых болот и небольших озер. На вершинах Алтайских гор есть ледники. На границе между Восточной и Южной Сибирью расположено озеро Байкал — крупнейший пресноводный водоем мира.
Байкал содержит пятую часть всех земных запасов пресной воды. Для сравнения, в нем содержится столько же воды, сколько и в Великих Озерах США. Байкальская вода так же известна своими целебными качествами и считается "живой водой".
Большое количество эндемичных видов растений и животных, обитающих по берегам озера, делают его самым богатым и с точки зрения биоразнообразия. В тайге обитают бурый медведь, лось, северный олень и сибирский соболь. В озере живет единственный в мире пресноводный тюлень - нерпа. Для ученых до сих пор остается загадкой, как нерпа попала в озеро.
В озере так же водится 53 вида рыб, влючая эндемиков - омуль, осетр, налим, щука, окунь, пескарь. Источник: http://www.ebftour.ru/bajkal_i_yuzhnaya_sibir_.htm
Южносибирская горная тайга представляет хозяйственный интерес как для лесной промышленности, так и для охотничье-промыслового хозяйства. Здесь обитают ценные пушные зверьки — соболь, белка и др.

В горах Южной Сибири идет освоение месторождений полезных ископаемых, лесных массивов и энергетических ресурсов. Развилась и традиционная отрасль хозяйства — животноводство; далеко в горы проникло земледелие. В настоящее время наиболее густо населены и освоены предгорные районы страны, и особенно равнинные пространства Кузнецкой и Минусинской котловин, Рудного Алтая, степи Бурятской АССР и Читинской области. В их пределах сформировались крупные территориально-производственные комплексы с предприятиями горнорудной, угольной, металлургической, химической, лесной, машиностроительной и легкой промышленности.