Дом простоял без присмотра дня три, а там уже грязь, вонь... Что случилось?

это просто бомжи переночевали пару раз...

Труп протух.

....кукушка в часах рылась везде, долго искала - но не нашла припрятанный для нее завтрак... и скончалась от голода...

некомпетентность домашней иерархии слуг, вызывает их страх и ненависть, ведущие к предательству, а страх и ненависть низших слуг дома ведет к открытому бунту.
поэтому помимо компетенции служак, необходим и верный человек наверху, определяющий общую линию дома, а это и единая объединяющая идея дома.

Причин может быть несколько:

Появление скрытых утечек. То есть, труба дала трещину, через которую незаметно сочится "фекалка". Тогда понятно, почему в туалете пахнет канализацией.
В этом же кроются причины запаха канализации в ванной. Особенно, если трубы скрыты в полу или стенах и место образовавшейся протечки обнаружить весьма проблематично. При этом следует проверить герметичность сантехнического оборудования (раковина, ванна, душевая кабинка и прочее).
Нарушение работы гидрозатворов и, как следствие — отсутствие вентиляции в системе и отвратительный запах канализации из унитаза и ванны. То есть, спускаемая вода в унитазе создаёт в системе разряжение и вода полностью уходит из сифона, а зловонные газы из-за отсутствия водяной пробки, беспрепятственно проникают в квартиру.
Но если уж совсем нестерпимо воняет канализацией в туалете, необходимо обследовать "стояк" —иногда причина кроется в нарушении его целостности, когда фекальные воды стекают по нему и издают зловоние.
Если идёт запах из канализации на кухне, необходимо тщательно обследовать место подсоединения мойки: возможно произошла небольшая разгерметизация, ставшая причиной данной неприятности.

Проведите микологическую экспертизу http://expbn.ru/mikologicheskaja-jekspertiza.html