В 1922 году монастырь закрыли, вместо него появился Музей раскрепощения женщин, а потом — Историко-бытовой и художественный музей «Новодевичий монастырь» . В настоящее время памятник старины вновь стал действующим.
Большой пруд у Новодевичьего, в котором так красиво отражается его ночная подсветка, имеет дурную славу. Говорят, что здесь, на льду, Петр I лично рубил головы восставшим стрельцам и заставлял своих сподвижников делать то же самое. Двух стрельцов в назидание повесили под окнами той самой монастырской башни, где содержалась опальная царица Софья. Их души с тех пор витают где-то рядом, равно как и души многих пленниц этой тихой твердыни.
Известно, что царевна Софья Алексевна была заточена в 1698 г. в Новодевичий монастырь «любимым» братом Петром I в целях не допустить её прихода на трон. Проживала царевна в покоях при Надпрудной башне. Дабы Софья пала духом, жестокий брат вешал верных её стрельцов прямо под окнами скромного монашеского обиталища сестры.
Говорят, если дотронуться до башни и загадать заветное желание оно непременно сбудется. Приходят на это место люди и с телесными болезнями и с душевными ранами, прикладываются к башне, просят усердно и башня помогает.
Люди верят вовсе не в башню, а в чудодейственную силу царевны Софьи, которая зорким глазом наблюдает за ними свысока и исполняет все просьбы страждущих.
К началу XX века территория монастырского некрополя была полностью заполнена, и в 1889 году ее впервые расширили — за южной стеной монастыря появилось кладбище, официально открытое в 1904 году, а после Октябрьской революции названное в народе «Новодевичье» .
У жителей близлежащих домов очень популярна мистическая история о женщине, которая отпросилась с работы, чтобы навестить могилу близкого родственника на Новодевичьем кладбище. Пока она покупала цветы и ехала через всю Москву, сгустились сумерки. Она, показав документ, пошла на могилу… и заблудилась. Ей навстречу попался гражданин. Она спросила у него дорогу. Он объяснил, но путано. Она попросила его проводить ее к могиле: «Уже темновато, а я покойников боюсь» . Он любезно повел ее по дорожкам и тупикам и вдруг, через плечо, спросил: «А вы не сможете мне объяснить, почему люди нас боятся? »
Как известно, частые продолжительные обмороки вызывали у Гоголя в его болезненном сознании страх быть принятым за умершего и оказаться заживо погребенным. Он просил похоронить его только при наличии явных признаков разложения, появления которых никто, разумеется, дожидаться не стал. Позже появились рассказы о якобы поврежденной, исцарапанной обшивке крышки гроба, о неестественном, как бы скрюченном положении скелета и слухи о том, что писателя похоронили живым, он очнулся в гробу, под землей, в отчаянии пытался выбраться и погиб от смертельного страха и удушья. Однако эти слухи были опровергнуты скульптором Аникушиным, который рассказал, что при изготовлении посмертной маски специальным раствором заливается все лицо, и, если даже человек был в летаргическом сне, он задохнется. Крышка гроба под воздействием времени и тяжести земли прогибается, и череп может самопроизвольно развернуться в другую сторону.

Однако мистика действительно имеет отношение к останкам великого писателя, и одна такая тайна не раскрыта до сих пор. В 1931 году в Москве переносили останки знаменитых россиян вместе с гранитными саркофагами (в том числе Хомякова и Языкова) из некрополя Свято-Даниловского монастыря, где был образован приемник для несовершеннолетних правонарушителей, на Но