Компьютер тормозит из за жесткого диска. В чем причина?

Ты сам и ответил на свой вопрос
Причина, из-за которой жесткий диск сам стал причиной торможения вероятней всего:
1) Колоссальная запись на этот жд, много и сразу
2) Огромный файл подкачки и мало ОЗУ
3) служба superfetch
4) служба поиска
5) злодеяния вируса
6) Антивирус / включена самая жёсткая защита от всего и вся, включая текстовые файлы .txt и тд
7) Падение устройства из-за чего диск сам себя поцарапал / заточил
проверить программой виктория

Вот этим по смотреть жд: Hard Disk Sentinel Pro

>>У кого нибудь было такое?

несколько раз и помогала замена диска, как ни странно

наверное это покажется удивительно, но в жёстком диске.
любой жёсткий диск будь то системный или дополнительный, может вешать всю систему, в случае неисправности или дохлого sata кабеля.

Не если диск неисправен, то все папки и игры будут лагать. Вы его вынимаете, и я так понял, что вас есть второй. Он исправен, поэтому все работает хорошо.

как это ты перед включением вынимаешь жесткий диск.... и че? без жесткого хорошо работает? быстро папки открывает? да ты от бога диагност

может жесткий близок к своему концу (
у меня было нечто подобное, совсем уж медленно стал работать
а пару гигив с него копировал минут 40

Устанавливай Windows на другой раздел.

Вот простая видео инструкция по диагностике жестких дисков, посмотри - https://youtu.be/m2yez_lGBEY