Есть ли новый закон в Москве, при оформлении нового загран паспорта отбирать старый с действующей визой?

Ну так прочтите Адм. регламент о выдаче загранпаспортов

23. Оформление паспорта нового поколения не допускается без изъятия ранее выданного паспорта нового поколения или иного паспорта, удостоверяющего личность гражданина Российской Федерации за пределами территории Российской Федерации17, если срок его действия не истек, или без объявления паспорта недействительным для выезда из Российской Федерации, если он утрачен владельцем, за исключением случая, предусмотренного частью третьей статьи 11 Федерального закона.
...

Паспорт с истекшим сроком действия не изымается.

По просьбе гражданина, если в действительном паспорте либо в паспорте нового поколения нет свободных страниц и имеются действующие визы иностранных государств, разрешается оставлять его у владельца. При этом в паспорте на тридцать шестой странице либо в паспорте нового поколения на третьей странице проставляется отметка "аннулировано".

В ФМС, возможно, прочитали первые две строчки, а дальше читать сил не хватило, или Вы просьбу оставить паспорт не заявили. А Вы весь текст прочтите и обратите внимание на то, что далее говорится в данном пункте. Ну и попросите оставить паспорт.

Эти вопросы не регулируются законами субъектов Федерации, например, Москвы или Еврейской автономной области. А .ФЗ "О порядке выезда... " ст. 11гласит "Не допускается, за исключением случаев, указанных в части третьей настоящей статьи: 2) выдача нового паспорта без изъятия ранее выданного паспорта, если срок его действия не истек". Т. е. паспорт с истекшим сроком действия могут вам оставить на память, надо только изъявить такое желание.
Кстати, зачем вам аннулированный паспорт с визой?

Это законами Москвы не регулируюется.
Правила одни по всей стране, и счас уже старый паспорт если его срок действия не истек не изымается