Подскажите почему шипят маленькие трех-недельные котята? и как отучить их от этого??

так всегда, подростут и перестанут.

моя кошка шипела в 2 месячном возрасте . когда я её забирала ...она шипела всю жизнь

Это естественно. Пусть шипят, это природой предусмотрено, так они выживают. Так они общаются с миром. Но странно, что у вас есть котята, а вы ничего не знаете. Читайте больше о разведении кошек, это будет полезно вам и животным в вашем доме. Есть много тонкостей, которые следует знать, чтобы не принести вреда и не закрепить вредных привычек, которые сделают малышей несчастными в новых домах. Не много людей, которые будут с адским терпением и любовью переучивать кошек.

бояться и защищаються, потом привыкнут-поймут, что нет опасности и перестанут

защитная реакция.
если хочешь не нарушить психику малышам - то оставь их в покое.
ещё успеешь поиграть

Чаще брать на руки, гладить, играть, ну и любить.

В первые недели жизни они иследуют мир, это нормально, но надо их конечно отучать, можно когда они будут шипеть легонько пошипите и вы только грозно но не до приступа котят))

ну это уже многое от воспитания зависит.. . та и от породы.. . если ангорка - то бесполезно что-то делать.. . а если другой породы или без.. . то можно что-то изменить.. . я помню когда тмон (кот) был маленьким он ни на кого не шипел, а тут вдруг и на маму зашипит.. . а она его по мордахе шлепнула легонько, после этого он такое не чудил) ) а вообще он был вредным) ) доводил до белого коления. .