Вопрос про православное "спасибо" (предназначен для православных).

Вопрос скорее в категорию русского языка и литературы. Действительно, выражение "Спаси Господи" в качестве благодарности неправильно, с точки зрения русского языка, по причине, которую Вы же и указали, что "Господи" - это звательный падеж.

Каждое общество требует своего общения, и "показушное" церковное общество требует такого обращения.
Вполне благочестиво с точки зрения Христианства говорить "спасибо", потому что это слово образовалось из выражения, "Спаси Бог".
Почему отвечают "Во славу Божию", и откуда это повелось, даже не знаю.

Ничего предосудительного здесь нет. Важна не буква закона, но его дух. По этому говорите как вам удобно, главное чтоб от души и с добрым помыслом.

Не лучше ли говорить "благодарю" и "пожалуйста"?

1) Обычно православные благодарят: "Спаси Господи".
Почему так? Ведь "Господи" - это звательный падеж? То есть, когда мы кого-то благодарим, мы себе желаем спасения, а не тому, кого благодарим?! Есть вариант "Спаси (вас) Господь" и он мне понятен... Вопрос скорее Христианский Ученики говорят спас Господи а Учителя наверно Спаси Господи Спасибо Николай Чудотворец.

Человек который прошёл крещение и внутреннее возрождение уже спасён, ему не надо каждый раз как заведённому бормотать "спаси господи". Так говорят обычно те кто к вере имеет отдалённое отношение, хотя он сам думает иначе. Вера в истинного бога это не служба в армии, одни и те же заученные слова обычно говорят язычники, истинно верующий говорит то что идёт от души.