Какие нужны документы для оформления шенгенских виз от предприятия (имеется ввиду без посредников)

Если у вас сотрудники оформлены на работу в иностранной компании, то лучше спросить в самом консульстве (на том сайте их телефон есть, дозваниваться сложно) .
Если они все-таки работают в российской компании (если компания зарегистрирована на юрлицо в России) , то нужно слеующее:
1. Справка с места работы с указанием должности, оклада, срока работы в компании.
2. Очень хорошо, если будет письмо-направление (типа Иванов, занимающий должность такую-то, направляется в периодические командировки в Эстонию по приглашению компании такой-то, являющейся головной компанией международного холдинга, представленного в России компанией "юрлицо в России", в обязанности Иванова будет входить то-то и то-то. Гарантиурем оплату командировочных и транспорта) .
3. Приглашение от компании в Эстонии, в котором будут перечислены все приглашаемые, их даты рождения, номера паспортов (загранов!) , должности в российской компании. Также нужно указать, что российская компания является представительством (например) эстонской компании в России. Указать, что покрываются расходы на проживание. Указать, что запрашиваются многократные визы на один год с, нгапример, 20.04.2011 по 19.04.2012.
Если на разных сотрудников запрашиваете с разных дат, то на каждого отдельное приглашение. Приглашения нужно в оригинале, с синей печатью - в Эстонии в основном печти синие, овальные или круглые.
4. Приложите актуальную (не позднее месяца) выписку из Эстонии из торгового реестра (она в электронном виде) на эстонскую компанию.
5. Очень желательно приложить документы, подтверждающие тесную связь между компаниями (подтверждение представительства интересов в России) .
6. На каждого человека по фотогрфии 3,5 на 4,5 см.
7. Можно приложить на сотрудников личные справки из банка - это повышает вероятность выдачи мультивиз. Или можно приложить справки 2-НДФЛ.
8. Желательно для каждого на первые поездки приложить брони авиабилетов или ж/д билетов.
9. Заполните у них на сайте анкеты в электронном виде (обязательно в электронном! )
10. Делаете на каждого сотрудника страховку, можно сделать и на первую поездку (по броням билетов) .
11. Если у людей были прошлые загранпаспорта, то сделайте копии первых страниц, а также шенгенских виз.
12. Делаете доверенность на бланке организации на занос документов на себя или на вашего курьера - советую пойти самой.
13. Звоните в консульство уже по другому телефону (на сайте есть) и записываетесь на подачу - можете записать только себя, уточните при записи, что будет несколько человек. Могут дать срок примерно на через неделю или даже на через две. Можно просить :) Если не будут упрашиваться, поможет звонок из Эстонии от имени головной компании.
13. Берете на каждого человека по 35 евро в кулак, все документы, оригиналы заграничных паспортов и идете в консульство в назначенный день в назначенную половину дня (утром или после двух) . Сдаете документы.
14. Через неделю получаете свои паспорта с визами.
Учтите, что на первый раз могут дать однократные визы или мульти 30 дней в коридоре 2 месяца или 30 дней в коридоре три месяца. После того, как отъездят, подавайте снова :)

Приглашение на фирменном бланке с указанием цели поездок
Контракт или документы подтверждающие взаимосвязь фирм
Копии трудовых книжек сотрудников
и как у всех анкета, деньги и пр.