Обязательна ли печать в паспорте при пересечении границы Россия-Казахстан для граждан РФ, если ехать на 3 дня?

во внутренние паспорта печать не ставят
в Казахстане вы обязаны зарегистрироваться если находитесь более 5 суток, а не трех

Какая печать? Если едешь по российскому внутреннему паспорту любая печать - это испорченный и недействительный паспорт. Должны выдавать миграционную карту и там все печати

Между Россией и Казахстаном действует безвизовый режим, для въезда в страну достаточно общегражданского или заграничного паспорта. В ближайшее время планируется переход на поездки по загранпаспортам. Безвизовый въезд подразумевает пребывание в течение 90 дней, после чего следует обратиться в соответствующие органы для оформления временного проживания на территории Казахстана.

Помимо граждан России, правом безвизового въезда в республику Казахстан пользуются граждане всех стран СНГ, Монголии и Турции.

При въезде в страну выдается иммиграционная карточка, на которой ставят штамп с датой въезда в Казахстан. На выезде данная карточка изымается сотрудниками пограничной службы. На этой же карточке делаются отметки органов учета и регистрации по месту пребывания. Еcли вы останавливаетесь в гостинице, отель берет вашу регистрацию на себя, а вам выдает соответствующую квитанцию.

Иностранные граждане, временно пребывающие в Республике Казахстан, обязаны зарегистрироваться в течение пяти календарных дней со дня пересечения государственной границы по месту своего постоянного или временного проживания. Регистрация иностранных граждан осуществляется по документам, удостоверяющим личность, и по иммиграционным картам, полученным при въезде.

Начиная с 01.01.2006 граждане всех стран, прибывающие через 12 международных аэропортов Казахстана (включая Алматы и Астану) , международный железнодорожный пункт пропуска Достык-Алашанькоу (с Китаем) , через международные автомобильные пункты пропуска Хоргос (с Китаем) , Достык (с Китаем) , Бахты, Майкапчагай, Кордай (Киргизия) , Кольжат и морские порты Актау и Баутино, имеют право получения регистрации на указанных пограничных пунктах. На другие пограничные переходы, в том числе железнодорожные с Россией, регистрация при въезде не распространяется, и сохраняется необходимость обращения в органы регистрации в течение пяти дней.

http://archive.travel.ru/kazakhstan/formalities/visas/