Как делают соты?

Лепят цилиндр из воска. А чтобы меньше материала тратить - пристраивают этот цилиндр к какой-нибудь стенке в уголке. Залезет в уголок и прямо вокруг себя лепит этот воск. Получается короткая трубочка. А следующий строитель - пристраивает свою трубочку рядышком, опять же для экономии материала. Именно из-за этого стремления к экономии трубочки и лепятся в наиболее геометрически выгодном порядке - в "гексагональной упаковке", как атомы во многих кристаллах строятся. А потом воск слегка ссыхается и истончается - и трубочки начинают походить на призмы.

Тот же эффект можно наблюдать и в неживой природе. Например, возьми блюдце, налей туда мыльной воды и выдуй в нее несколько сотен мелких пузырьков через медицинскую иглу. Эти пузырьки тоже будут стараться расположиться в виде шестиугольной сеточки - и по той же причине.

Напильником из улья выпиливают.

Всё по демократически. Американские пчёлы экспортируют на весь мир. За нектар и мозги.

Давно делают простейшими машинками: два валика, на которыз прорезаны площадки - дно сота и канавки - начала стенок. между ними прокатыват восковую пластину, закрепляют в рамке и ставят в улей. Пчелы сами достраивают до нужных размеров.
Аветисян Разведение и содержание пчел
www.brocgaus.ru/text/082/963.htm

У пчел есть восковые железы (по-моему на брюшке), они выделяют воск в виде капелек, из них они жвалами строят соты.