Почему в школах ДИРЕКТОР, а университетах просто РЕКТОР, и в чём разница?

В принципе,разницы нет. Что ректор,что директор. Есть ещё проректор - заместитель ректора. Директором обычно называют руководителя подразделения. Художественный директор,технический директор ... Видимо школа - одно из начальных подразделений образования.

школа дает начальное оброзование ,поэтому приставка ДИ иметься у РЕКТОРА