как прописать ребенка к отцу в в/ч

Если сам военнослужащий зарегистрирован по адресу воинской части, то и члены его семьи могут быть зарегистрированы в том же порядке. Отказать в этом не могут.

Это сам отец должен делать, без согласия в/ч, если ребенок несовершеннолетний

Точно также, как и муж прописался.