каким образом атом может быть положительным ионом?

Атом, потерявший электрон, имеет положительный
заряд и называется положительным ионом.

Ионы - это заряженные частицы, в которые превращаются нейтральные атомы и молекулы при отдаче или присоединения ими электронов.