Скольки PINовый должен быть корпусный кулер, чтобы он мог регулироваться програмно (типа SpeedFan)?

Это от матплаты зависит. Чаще 4, но иногда, на старых моделях, типа Socket-775 и AM2, регулировка работает и на 3-pin вентиляторах.