Саяны и Кузнецкий Алатау входят в состав Красноярского края?

Входят.
Наиболее крупными орографическими единицами Красноярского края являются Восточный Саян (высоты в пределах края до 2922 м) , Западный Саян (высоты до 2930 м) , а также Абаканский хребет, восточные склоны Кузнецкого Алатау. http://allencyclopedia.ru/37880