Сколько времени нужно ждать деньги которые положил через терминал на яндекс деньги ?

Посмотрите список терминалов
http://money.yandex.ru/doc.xml?id=522781
Большинство из них зачисляют деньги мгновенно, некоторые до суток.

Что делать, если платеж через терминал не дошел?
Обратитесь в службу поддержки терминальной сети, через которую платили.
http://money.yandex.ru/doc.xml?id=524781#qu14