Главная проблема романа- это проблема свободы.
Зурита покусился на свободу Ихтиандра, но он не был здесь первым.
Первым позволил себе это, но более тонко и искусно,
названый "отец" Ихтиандра - хирург Сальватор.
Сделал он это под предлогом совершенствования человеческой
природы.
"Человек несовершенен",- говорил он.
Потом, когда Сальватор пересадил Ихтиандру жабры акулы,
он будет о нем заботиться, защищать и, может быть,
даже любить. Но раньше он просто забрал у него свободу.
Сальватор не вызывает такого однозначного неприятия,
как Зурита.
Но если вдуматься, он не менее опасен, чем прямолинейный Зурита.
Став по воле хирурга человеком-рыбой - не таким, как все,
Ихтиандр попадает в водоворот драматических событий.
На него началась охота, завершившаяся потерей свободы.
Далее-это проблема науки и проблема морали.
Ихтиандр - дитя научных опытов хирурга Сальватора.
Получился человек-акула.
Но стала ли эта операция благом для Ихтиандра?
Вначале мы видим его, если не абсолютно счастливым,
то довольным своей жизнью.
Сальватор подарил Ихтиандру море.
Правда, тут же ограничил его пребывание на земле.
В конце концов среда обитания Ихтиандра ограничилась
бочкой с водой.
Беляев убедителен, когда говорит, что наука - это не
только огромные возможности, но ещё и огромная
ответственность за человека.
Проблемы власти и господства церкви в
латиноамериканской стране.
По воле автора в романе сталкиваются интересы
Церкви и государства, показывается конфликт прокурора
города и епископа.
Предмет конфликта - морской дьявол, человек-рыба,
на факт существования которого прокурор и епископ
смотрят по-разному.
Епископ в разговоре с прокурором заявляет:
"Безбожник Сальватор и омерзительное детище его рук -
Ихтиандр - дерзкий вызов Церкви, Богу, небу.
И Церковь не сложит оружия, пока они не будут уничтожены".
Воинственная речь Сальватора звучит как обвинение
существующему строю: "Я не мог Ихтиандра сделать общим
достоянием в стране, где борьба и алчность обращают
величайшее открытие во зло, увеличивая сумму человеческого
страдания".
Даже смотритель тюрьмы, помогавший бежать Ихтиандру,
невысокого мнения о своей стране:
"Здесь вершат дела попы и купцы".
Человек не может быть счастлив среди рыб, ему нужны люди.