Подскажите консольную команду stalker lost alpha, чтобы fps больше стал

Тебя обманули: такой команды НЕТ!
Правда, есть команды для настройки графики. Если с ними поиграться, то можно добиться некоторого прироста ФПС.

Список команд и их значения смотри в таблице: http://mpnetworks.ru/publications/stk/stkcop-con-cmd