Я проходил медосмотр в 16 лет (Украина) в военкоммате, у меня плоскостопие с которым не берут в армию, мне надо опять

будет проходит медосмотр в 17,18 лет?

В призывной период (в 18 лет) вам надо будет проходить медосвидетельствование и призывную комиссию, которая и будет решать вашу участь.