Евгений
У этого слова два суффикса: -а и -нн
анн
пере-приставка, путан-корень, н-суффикс, ый-окончание
Пере-пут-А-ть вот этот суффикс -А- участвует в словообразовании, его надо обязательно выделять.
пере-пут-А-НН-ый, добавили -НН- и получилось причастие