Жесткий диск на ноуте разбит на два (С и D) ноут заражен пенетратором. если отформатировать С на D вирус останется?

Если форматнуть диск Д, то на С все останеться, ну или на оборот.

Естественно. Но можно, отформатировав диск С: , переставить систему, антивирус и просканировать диск .