В этом случае Вам за день неявки будет проставлено нарушение режима и со дня неявки пособие по временной нетрудоспособности будет выплачиваться в размере 1 минимального размера оплаты труда (то есть как минимум за день неявки будет выплачено уменьшенное пособие, а если дальше листок нетрудоспособности будет продлеваться, то до конца срока временной нетрудоспособности) .
Правда, если врач некомпетентный и по уровню образования не отличается от пациента, то тут возможны варианты "запудрить мозги" в духе совета Сумрака Разума или договориться, но, судя по Вашему описанию, врач компетентный и своё дело знает, всё Вам объясняет правильно.
В утешение Вам могу сказать, что если листок нетрудоспособности Вам продлён по первый день очередного оплачиваемого отпуска, то отпуск продлится (перенесётся) на 1 день, а если листок нетрудоспособности будет продлеваться и далее, то это продление (перенесение) осуществится на всё количество дней временной нетрудоспособности с момента наступления отпуска.