удаляется ли архив сообщений при удалении мир mail.ru, или это привязано к почте?

Конечно, удаляется. Остаются только письма в почте, а переписка в Моем Мире удаляется вместе со страницей. Почта - это почта, а Мой Мир - это Мой Мир. ЛС в Мире и письма в почте - разные вещи.