Придут ли деньги с Яндекс Денег на карту Visa Сбербанка, если аккаунт был удалён?

Даже если деньги не отправлены в банк платежной системой после удаления аккаунта, придти деньги должны.
Если не придут, это деньги Ваши, пишите в техподдержку. Если аккаунт идентифицирован был, тут еще проще - с паспортом в офис пл. системы. Да и вообще - аккаунт, это Вы называете эл. почту? Попробуйте восстановить почту кстати, также, через техдд.