Есть ли различие между термостатами для ваз 2106 и 2109 ?

конечно

да, это очень разные движки-один фиатовский, другой от порше

Только по развороту патрубков.

патрубки в разные стороны

ни того ни того ни видел, ни чего не могу сказать по этому поводу

Различные по температуре срабатывания и положению (углу ) входов и выходов.. . Зачем колхозить - бери родной!!

разная температура открытия .Цифры не помню

разное расположение патрубков