уплата НДФЛ?

А в фондах - ПФР, ФСС и медстрах - тоже не встали на учет? Если нет, то плохо, там какие-то сроки есть с момента заключения 1-го трудового договора.
1. Начислить налоги, кроме НДФЛ видимо еще ЕСН (если у Вас ОСНО) , либо взносы в ПФР и ФСС (если УСНО) .
2. Заплатить их (после постановки на учет в фондах) .
3. Срочно сдать необходимую отчетность по ЕСН или взносам в ПФР и ФСС за 2 квартал. Если УСНО, то срок только в ФСС прошел 15-го, оштрафуют за несвоеврем сдачу, а остальное не страшно. По ЕСН (если Вы на ОСНО) сроки на днях прошли, и в ФСС тоже 15-го.
По НДФЛ пени за несвоевременную оплату начислят после проверки, когда она у Вас будет.
А по фондам после сдачи отчетности и оплаты.
Пени - не страшно, хуже штрафы за несвоевременную сдачу отчетности.

Застрелиться )
Идти на сверку в налоговую инспекцию, рассчитывать пени.
Погашать недоимку.

Я бы для начала пересчитала все сама, затем проплатила (можно сделать небольшую переплату) , а потом уже сверялась. А как банк выдавал деньги, у нас провер опл. ли налоги с ФОТ.

Только 2 месяца и пропустили всего. Налоговый период по НДФЛ - год. Сведения поступят в налоговую только в 2010 году. Начислите налоги и оплатите. Несвоевременная оплата обнаружится только при выездной проверке по НДФЛ. В худшем случае налоговая доначислит налог на прибыль - типа имели доход за счет удержанного НДФЛ, может чуть оштрафует.

Срочно пересчитайте налоги, заплатите их. Отчеты, как я поняла, тоже не сдавались? Срок сдачи уже прошел, так что Вас ждут штрафы за несвоевременную сдачу. Сдайте сначала нулевые расчеты по аванс. платежам по ЕСН и ОПС, а недельки через 2 - уточненки с цифрами, тогда будет только административный штраф. И идите на сверку через 1-2 недели после сдачи уточненок. Удачи!!!