Имеют ли право налоговые службы проверять остаток по кассовой книге с реальным остатком в сейфе?

Да.
Прежде всего проверяющий сотрудник налоговой инспекции должен составить справку. В ней он указывает выявленные случаи нарушения порядка хранения денег в кассе. Справка составляется в произвольной форме.
Затем эту справку проверяющие должны направить в обслуживающий фирму банк.
Банк должен проверить фирму по этому "сигналу" и составить свою справку по форме № 0408026. Налоговая инспекция в течение двух дней с момента получения этого документа составляет протокол об административном правонарушении. Фирму (или руководителя) , как нарушителя, должны уведомить о времени и месте составления протокола. Протокол в присутствии представителя фирмы должен рассматривать руководитель налоговой инспекции.
По результатам рассмотрения он выносит постановление о назначении штрафа.

Источник: «Методические рекомендации по осуществлению налоговыми органами контроля за соблюдением порядка ведения операций с денежной наличностью, получаемой с применением контрольно-кассовых машин и бланков строгой отчетности, при реализации товаров и оказании услуг населению»

имеют! С этого и начинается ревизия или проверка!

Читаем первоисточник – ч. 1 НК РФ:

Статья 87. Налоговые проверки
...
2. Целью камеральной и выездной налоговых проверок является контроль за соблюдением налогоплательщиком, плательщиком сборов или налоговым агентом законодательства о налогах и сборах.

Читаем первоисточник – КоАП РФ:
Статья 23.5. Налоговые органы

1. Налоговые органы рассматривают дела об административных правонарушениях, предусмотренных частью 2 статьи 14.5, статьями 15.1, 15.2 настоящего Кодекса.

Статья 15.1. Нарушение порядка работы с денежной наличностью и порядка ведения кассовых операций
Нарушение порядка работы с денежной наличностью и порядка ведения кассовых операций, выразившееся в осуществлении расчетов наличными деньгами с другими организациями сверх установленных размеров, неоприходовании (неполном оприходовании) в кассу денежной наличности, несоблюдении порядка хранения свободных денежных средств, а равно в накоплении в кассе наличных денег сверх установленных лимитов, -
влечет наложение административного штрафа на должностных лиц в размере от четырех тысяч до пяти тысяч рублей; на юридических лиц - от сорока тысяч до пятидесяти тысяч рублей.

Некоторые специалисты считают, что в данном контексте речь идет только о «рассмотрении» дел и о наложении штрафов. А проверять, дескать, налоговые органы не могут, поскольку это прерогатива банков. Увы, это не так. Банки сами по себе обязаны проверять, а налоговики сами по себе имеют право проверят кассовую дисциплину, а точнее, полноту учета выручки.
Читаем «Положения о Федеральной налоговой службе» , утвержденное Постановлением Правительства Российской Федерации от 30.09.04 № 506:

5. Федеральная налоговая служба осуществляет следующие полномочия в установленной сфере деятельности:
5.1. осуществляет контроль и надзор за:
...
5.1.7. полнотой учета выручки денежных средств в организациях и у индивидуальных предпринимателей;

согласно и не спорю, но за 20 лет работы в розничной торговле ни разу налоговики не снимали фактические остатки в кассах!!!! Моежт повезло?? ? Интересно, а кто с этим сталкивался на практике и какие были последствия?