Как в 1С Бухгалтерия 8.2 сделать наценку (опт) в накладной на продажу не в каждой из строк отдельно, а сразу во всех.

В Конфигураторе. Лучше пригласить программиста (да и то, после каждого обновления будет слетать..).

в 1С 7.7 я бы тебе спрограммировал, а в 1С 8 нет.

А что, там нет стандартных средств?
а от какой цены наценка считется?

Бухгалтерия таких возможностей не имеет. Для этого нужна Торговля+склад )там можно так наценить) А потом перегрузить в бухгалтерию полученный документ.

1С 8.2 Бухгалтерия - бухгалтерская программа, в ней нет управленческого учета, а вопрос ценообразования как раз относится к управлению. И если при небольшом объеме номенклатуры еще можно худо-бедно "торговать" в Бухгалтерии, то при Вашем обороте надо уже ставить Управление торговлей, где как раз и есть возможность устанавливать различные наценки на товар, и скидки отдельным категориям покупателей. Базовая торговля стоит 4500 руб.

Вносить какие-либо изменения в конфигурацию я бы не советовал, т. к. законы у нас меняются часто, а обновляться после изменений будет проблематично.
При номенклатуре до 2000, и несложном ценообразовании можно попробовать выйти из ситуации без покупки УТ.
1. Сохраняем список номенклатуры (остатки по счету 41.01 с кол-во и сумой) в формате Exel.
2. В Exel добавляем формулу, которая рассчитывает нам наценку.
3. Просим программиста сделать обработку по загрузке данных из Exel в документ "Установка цен". Данная обработка обойдется в пределах 1000 руб.

При вводе новой номенклатуры можно ввести оптовые цены, розничные % наценки и многое другое по ценам. При обновлении ничего не слетает. И по каждому клиенту устанавливается своя цена.