договор с НДС или без НДС?

За что Вы получаете 1200? ООО на ОСНО оплачивает Вам за Ваши услуги или за Ваш товар, Вы - продавец. Как ИП на УСН Вы должны продавать ему без НДС. 1200 руб - это Ваш доход, он не должен быть с НДС. Если ООО просит Вас продать ему с НДС, то Вы будете обязаны выставить ему счёт-фактуру с НДС и оплатить этот НДС. Вам не выгодно, и ООО тоже может быть не выгодно покупать у Вас без НДС, ведь они не смогут уменьшить свой НДС.

Вы должны сказать этому ООО: я продаю без НДС. Если не хотите - покупайте у другого.

С дохода 1200 Вы по-любому должны оплатить налог 6%, так что чистыми 1200 не получится никак получить. Вариант для Вас получить 1200 чистыми: договор не как с ИП, а как с физлицом, тогда ООО должно назначить Вам вознаграждение 1379 руб, удержать с него 13% ндфл, Вам останется 1200, да ещё они должны зарплатные налоги заплатить с суммы 1379. Вряд ли им это выгодно.

Какой у тебя статус предпринимателя и система налогообложения? Или ты просто физическое лицо?

Если вы как ИП на УСН 6% заключите договор, в котором пропишите НДС и документы будете выставлять с НДС, то вы с 1200 рублей уплатите 6%, но и еще НДС с 1200 рублей перечислите в бюджет, раз вы документы оформили с НДС. И второй момент, вы забыли про размер страховых взносов 27 990 рублей, которые вы обязаны будете уплатить, но которые уменьшат ваш налог УСН 6%.
1. В договоре вы должны прописать фразу "НДС не облагается". Можете написать фразу в договоре, что вы применяете систему налогообложения. И не выдавайте счета-фактуры, а в актах пишите "без НДС".
2. Согласно пункту 3.1 статьи 346.21 НК РФ ИП, выбравшие в качестве объекта налогообложения "доходы", уменьшают сумму налога (авансовых платежей по налогу) на уплаченные страховые взносы. Это закон дает такое послабление упрощенцам. Если вы этого раньше не знали, то как же вы тогда налоговую декларацию составляли?

1. Если ООО является плательщиком НДС, то в договоре даже если вы не укажете, что сумма с НДС или нет, по умолчанию будет считаться с НДС. Тому подтверждение множество судебных решений.
2. Так как вы зарегистрированы в режиме УСН (6%), то вы не являетесь плательщиком НДС в данной ситуации, а значит в налоговую базу будет попадать общая сумма с НДС. Например, в договоре 1200 р в месяц с НДС, то после поступления оплаты УСН = 1200 * 6%.